عام 1897 م اكتشف ثومسون الإلكترون ، وفي نفس العام قدم ثومسون للعالم نموذج فطيرة الزبيب والذي يصور الذرة على أنها كرات موجبة الشحنة تنتشر فيها دقائق سالبة الشحنة (إلكترونات) كما تتوزع حبات الزبيب في الفطيرة.

تمكن هذا النموذج من تفسير تجارب ثومسون حول الكهرباء ولكنه لم يفسر التفاعلات الكيميائية للذرات.

نموذج رذرفورد :

عام 1909 م اكتشف ارنست رذرفورد البروتون ، وبعد ذلك بسنتين اكتشف النواة ، وعلى اثر ذلك قدم نموذجاً للذرة افترض فيه أن الإلكترونات تدور في فراغ كبير حول نواة صغيرة الحجم وتحتوي على بروتونات .