ج) أمراض المناعة ضد الذات Autoimmune Diseases :

ينتج جهاز المناعة أحياناً أجساماً مضادة ضد مولدات الضد الخاصة بخلايا الجسم نفسه, باعتبارها خلايا غريبة عنه, وينتج عن ذلك عدد كبير من الأمراض الخطيرة.
 مثال :
يكون الجسم أحياناً أجساماً مضادة ضد مستقبلات الناقل التشابكي أستيل كولين الموجود على غشاء الخلية العضلية المخططة مؤدياً إلى منع الناقل التشابكي من نقل السيال العصبي إلى العضلة, ومن ثم  منع العضلة من الانقباض والاستجابة للأوامر العصبية, الأمر الذي يجعل حركة الفرد عسيرة.